Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf11bB4XVQ1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms