Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah3B2RWG3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms