Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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PtprbB2RU80 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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PtprbB2RU80 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PtprbB2RU80 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
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