Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zscan5bB2RTN3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms