Protein–RNA interactions for Protein: B2RS76

Cpb1, Carboxypeptidase B1 (Tissue), isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpb1B2RS76 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Cpb1B2RS76 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cpb1B2RS76 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cpb1B2RS76 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cpb1B2RS76 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cpb1B2RS76 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cpb1B2RS76 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cpb1B2RS76 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cpb1B2RS76 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cpb1B2RS76 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpb1B2RS76 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpb1B2RS76 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpb1B2RS76 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpb1B2RS76 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpb1B2RS76 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpb1B2RS76 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpb1B2RS76 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpb1B2RS76 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpb1B2RS76 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpb1B2RS76 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpb1B2RS76 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpb1B2RS76 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpb1B2RS76 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpb1B2RS76 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpb1B2RS76 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpb1B2RS76 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpb1B2RS76 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpb1B2RS76 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpb1B2RS76 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpb1B2RS76 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpb1B2RS76 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpb1B2RS76 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpb1B2RS76 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpb1B2RS76 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpb1B2RS76 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpb1B2RS76 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpb1B2RS76 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpb1B2RS76 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpb1B2RS76 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpb1B2RS76 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpb1B2RS76 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cpb1B2RS76 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpb1B2RS76 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpb1B2RS76 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpb1B2RS76 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpb1B2RS76 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpb1B2RS76 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpb1B2RS76 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpb1B2RS76 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpb1B2RS76 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpb1B2RS76 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpb1B2RS76 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpb1B2RS76 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpb1B2RS76 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpb1B2RS76 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpb1B2RS76 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpb1B2RS76 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpb1B2RS76 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpb1B2RS76 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpb1B2RS76 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpb1B2RS76 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpb1B2RS76 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpb1B2RS76 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpb1B2RS76 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpb1B2RS76 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpb1B2RS76 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpb1B2RS76 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpb1B2RS76 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpb1B2RS76 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpb1B2RS76 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpb1B2RS76 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpb1B2RS76 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpb1B2RS76 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpb1B2RS76 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpb1B2RS76 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cpb1B2RS76 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cpb1B2RS76 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cpb1B2RS76 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cpb1B2RS76 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cpb1B2RS76 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cpb1B2RS76 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cpb1B2RS76 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cpb1B2RS76 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cpb1B2RS76 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cpb1B2RS76 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cpb1B2RS76 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cpb1B2RS76 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cpb1B2RS76 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cpb1B2RS76 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cpb1B2RS76 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cpb1B2RS76 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cpb1B2RS76 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cpb1B2RS76 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cpb1B2RS76 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cpb1B2RS76 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cpb1B2RS76 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cpb1B2RS76 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Cpb1B2RS76 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cpb1B2RS76 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cpb1B2RS76 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms