Protein–RNA interactions for Protein: B2RR83

Ythdc2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc2B2RR83 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ythdc2B2RR83 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ythdc2B2RR83 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ythdc2B2RR83 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ythdc2B2RR83 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ythdc2B2RR83 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ythdc2B2RR83 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ythdc2B2RR83 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ythdc2B2RR83 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ythdc2B2RR83 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ythdc2B2RR83 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ythdc2B2RR83 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ythdc2B2RR83 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ythdc2B2RR83 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ythdc2B2RR83 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ythdc2B2RR83 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ythdc2B2RR83 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ythdc2B2RR83 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ythdc2B2RR83 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ythdc2B2RR83 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ythdc2B2RR83 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ythdc2B2RR83 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ythdc2B2RR83 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ythdc2B2RR83 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ythdc2B2RR83 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ythdc2B2RR83 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ythdc2B2RR83 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ythdc2B2RR83 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ythdc2B2RR83 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ythdc2B2RR83 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ythdc2B2RR83 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ythdc2B2RR83 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ythdc2B2RR83 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ythdc2B2RR83 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ythdc2B2RR83 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ythdc2B2RR83 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Ythdc2B2RR83 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Ythdc2B2RR83 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ythdc2B2RR83 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ythdc2B2RR83 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ythdc2B2RR83 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Ythdc2B2RR83 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ythdc2B2RR83 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ythdc2B2RR83 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ythdc2B2RR83 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ythdc2B2RR83 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ythdc2B2RR83 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ythdc2B2RR83 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ythdc2B2RR83 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ythdc2B2RR83 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ythdc2B2RR83 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ythdc2B2RR83 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ythdc2B2RR83 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ythdc2B2RR83 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ythdc2B2RR83 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ythdc2B2RR83 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ythdc2B2RR83 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ythdc2B2RR83 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ythdc2B2RR83 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ythdc2B2RR83 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ythdc2B2RR83 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ythdc2B2RR83 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ythdc2B2RR83 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ythdc2B2RR83 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ythdc2B2RR83 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ythdc2B2RR83 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ythdc2B2RR83 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ythdc2B2RR83 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ythdc2B2RR83 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ythdc2B2RR83 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ythdc2B2RR83 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ythdc2B2RR83 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ythdc2B2RR83 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ythdc2B2RR83 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ythdc2B2RR83 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ythdc2B2RR83 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ythdc2B2RR83 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ythdc2B2RR83 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ythdc2B2RR83 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ythdc2B2RR83 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ythdc2B2RR83 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ythdc2B2RR83 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ythdc2B2RR83 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ythdc2B2RR83 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ythdc2B2RR83 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ythdc2B2RR83 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ythdc2B2RR83 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ythdc2B2RR83 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ythdc2B2RR83 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ythdc2B2RR83 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ythdc2B2RR83 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ythdc2B2RR83 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ythdc2B2RR83 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ythdc2B2RR83 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ythdc2B2RR83 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ythdc2B2RR83 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ythdc2B2RR83 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ythdc2B2RR83 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ythdc2B2RR83 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ythdc2B2RR83 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms