Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

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Length 756 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zbed5B2RPU8 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zbed5B2RPU8 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms