Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Uhrf1bp1B2KF50 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Uhrf1bp1B2KF50 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Uhrf1bp1B2KF50 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Uhrf1bp1B2KF50 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Uhrf1bp1B2KF50 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms