Protein–RNA interactions for Protein: B1AZQ8

Cldn34b1, Claudin 34B1, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b1B1AZQ8 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34b1B1AZQ8 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34b1B1AZQ8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34b1B1AZQ8 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34b1B1AZQ8 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34b1B1AZQ8 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34b1B1AZQ8 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34b1B1AZQ8 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34b1B1AZQ8 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34b1B1AZQ8 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34b1B1AZQ8 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34b1B1AZQ8 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34b1B1AZQ8 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34b1B1AZQ8 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34b1B1AZQ8 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34b1B1AZQ8 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34b1B1AZQ8 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34b1B1AZQ8 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34b1B1AZQ8 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34b1B1AZQ8 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34b1B1AZQ8 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34b1B1AZQ8 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34b1B1AZQ8 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34b1B1AZQ8 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34b1B1AZQ8 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34b1B1AZQ8 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34b1B1AZQ8 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34b1B1AZQ8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34b1B1AZQ8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34b1B1AZQ8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34b1B1AZQ8 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34b1B1AZQ8 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34b1B1AZQ8 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34b1B1AZQ8 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn34b1B1AZQ8 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn34b1B1AZQ8 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn34b1B1AZQ8 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn34b1B1AZQ8 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn34b1B1AZQ8 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn34b1B1AZQ8 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn34b1B1AZQ8 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn34b1B1AZQ8 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn34b1B1AZQ8 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn34b1B1AZQ8 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn34b1B1AZQ8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn34b1B1AZQ8 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn34b1B1AZQ8 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn34b1B1AZQ8 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn34b1B1AZQ8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn34b1B1AZQ8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn34b1B1AZQ8 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn34b1B1AZQ8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn34b1B1AZQ8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn34b1B1AZQ8 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34b1B1AZQ8 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34b1B1AZQ8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34b1B1AZQ8 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34b1B1AZQ8 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34b1B1AZQ8 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34b1B1AZQ8 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34b1B1AZQ8 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34b1B1AZQ8 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34b1B1AZQ8 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34b1B1AZQ8 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34b1B1AZQ8 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34b1B1AZQ8 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34b1B1AZQ8 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34b1B1AZQ8 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34b1B1AZQ8 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34b1B1AZQ8 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34b1B1AZQ8 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34b1B1AZQ8 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34b1B1AZQ8 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34b1B1AZQ8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34b1B1AZQ8 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34b1B1AZQ8 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34b1B1AZQ8 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34b1B1AZQ8 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34b1B1AZQ8 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34b1B1AZQ8 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34b1B1AZQ8 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34b1B1AZQ8 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34b1B1AZQ8 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34b1B1AZQ8 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34b1B1AZQ8 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34b1B1AZQ8 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34b1B1AZQ8 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34b1B1AZQ8 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34b1B1AZQ8 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34b1B1AZQ8 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34b1B1AZQ8 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34b1B1AZQ8 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34b1B1AZQ8 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34b1B1AZQ8 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34b1B1AZQ8 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34b1B1AZQ8 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34b1B1AZQ8 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34b1B1AZQ8 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34b1B1AZQ8 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34b1B1AZQ8 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms