Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NhsB1AV60 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NhsB1AV60 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NhsB1AV60 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NhsB1AV60 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NhsB1AV60 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NhsB1AV60 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NhsB1AV60 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NhsB1AV60 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NhsB1AV60 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NhsB1AV60 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NhsB1AV60 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NhsB1AV60 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NhsB1AV60 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NhsB1AV60 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NhsB1AV60 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NhsB1AV60 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NhsB1AV60 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NhsB1AV60 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NhsB1AV60 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NhsB1AV60 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NhsB1AV60 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NhsB1AV60 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NhsB1AV60 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NhsB1AV60 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NhsB1AV60 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NhsB1AV60 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NhsB1AV60 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NhsB1AV60 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NhsB1AV60 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NhsB1AV60 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NhsB1AV60 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NhsB1AV60 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NhsB1AV60 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NhsB1AV60 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NhsB1AV60 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NhsB1AV60 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NhsB1AV60 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NhsB1AV60 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NhsB1AV60 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NhsB1AV60 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NhsB1AV60 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NhsB1AV60 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NhsB1AV60 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NhsB1AV60 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NhsB1AV60 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NhsB1AV60 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NhsB1AV60 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NhsB1AV60 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NhsB1AV60 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NhsB1AV60 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NhsB1AV60 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NhsB1AV60 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NhsB1AV60 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NhsB1AV60 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NhsB1AV60 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NhsB1AV60 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NhsB1AV60 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NhsB1AV60 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NhsB1AV60 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NhsB1AV60 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NhsB1AV60 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NhsB1AV60 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NhsB1AV60 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NhsB1AV60 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NhsB1AV60 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NhsB1AV60 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NhsB1AV60 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NhsB1AV60 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NhsB1AV60 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NhsB1AV60 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NhsB1AV60 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NhsB1AV60 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NhsB1AV60 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NhsB1AV60 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NhsB1AV60 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NhsB1AV60 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NhsB1AV60 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NhsB1AV60 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NhsB1AV60 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NhsB1AV60 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NhsB1AV60 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NhsB1AV60 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NhsB1AV60 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NhsB1AV60 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NhsB1AV60 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NhsB1AV60 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NhsB1AV60 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NhsB1AV60 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NhsB1AV60 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NhsB1AV60 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NhsB1AV60 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NhsB1AV60 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NhsB1AV60 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NhsB1AV60 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NhsB1AV60 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NhsB1AV60 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NhsB1AV60 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NhsB1AV60 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NhsB1AV60 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms