Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Spocd1B1ASB6 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms