Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Grik3B1AS29 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Grik3B1AS29 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Grik3B1AS29 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Grik3B1AS29 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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