Protein–RNA interactions for Protein: A6X8Z9

4930435E12Rik, RIKEN cDNA 4930435E12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930435E12RikA6X8Z9 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
4930435E12RikA6X8Z9 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
4930435E12RikA6X8Z9 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
4930435E12RikA6X8Z9 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
4930435E12RikA6X8Z9 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
4930435E12RikA6X8Z9 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
4930435E12RikA6X8Z9 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
4930435E12RikA6X8Z9 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
4930435E12RikA6X8Z9 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms