Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9F0

Ttll7, Tubulin polyglutamylase TTLL7, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll7A4Q9F0 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttll7A4Q9F0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttll7A4Q9F0 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttll7A4Q9F0 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttll7A4Q9F0 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttll7A4Q9F0 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttll7A4Q9F0 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttll7A4Q9F0 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttll7A4Q9F0 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttll7A4Q9F0 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttll7A4Q9F0 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttll7A4Q9F0 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttll7A4Q9F0 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttll7A4Q9F0 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttll7A4Q9F0 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ttll7A4Q9F0 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ttll7A4Q9F0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ttll7A4Q9F0 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ttll7A4Q9F0 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ttll7A4Q9F0 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ttll7A4Q9F0 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ttll7A4Q9F0 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ttll7A4Q9F0 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ttll7A4Q9F0 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ttll7A4Q9F0 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ttll7A4Q9F0 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ttll7A4Q9F0 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ttll7A4Q9F0 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ttll7A4Q9F0 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ttll7A4Q9F0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ttll7A4Q9F0 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ttll7A4Q9F0 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ttll7A4Q9F0 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ttll7A4Q9F0 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ttll7A4Q9F0 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ttll7A4Q9F0 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ttll7A4Q9F0 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ttll7A4Q9F0 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ttll7A4Q9F0 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ttll7A4Q9F0 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ttll7A4Q9F0 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ttll7A4Q9F0 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ttll7A4Q9F0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ttll7A4Q9F0 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ttll7A4Q9F0 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ttll7A4Q9F0 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ttll7A4Q9F0 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ttll7A4Q9F0 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ttll7A4Q9F0 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ttll7A4Q9F0 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ttll7A4Q9F0 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ttll7A4Q9F0 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ttll7A4Q9F0 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ttll7A4Q9F0 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ttll7A4Q9F0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ttll7A4Q9F0 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ttll7A4Q9F0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ttll7A4Q9F0 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ttll7A4Q9F0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ttll7A4Q9F0 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ttll7A4Q9F0 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ttll7A4Q9F0 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ttll7A4Q9F0 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ttll7A4Q9F0 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ttll7A4Q9F0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ttll7A4Q9F0 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ttll7A4Q9F0 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ttll7A4Q9F0 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ttll7A4Q9F0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ttll7A4Q9F0 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ttll7A4Q9F0 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ttll7A4Q9F0 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ttll7A4Q9F0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ttll7A4Q9F0 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ttll7A4Q9F0 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ttll7A4Q9F0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ttll7A4Q9F0 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ttll7A4Q9F0 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ttll7A4Q9F0 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ttll7A4Q9F0 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ttll7A4Q9F0 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ttll7A4Q9F0 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ttll7A4Q9F0 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ttll7A4Q9F0 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ttll7A4Q9F0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ttll7A4Q9F0 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ttll7A4Q9F0 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ttll7A4Q9F0 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ttll7A4Q9F0 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ttll7A4Q9F0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ttll7A4Q9F0 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ttll7A4Q9F0 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ttll7A4Q9F0 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ttll7A4Q9F0 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ttll7A4Q9F0 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ttll7A4Q9F0 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ttll7A4Q9F0 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ttll7A4Q9F0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ttll7A4Q9F0 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ttll7A4Q9F0 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms