Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scn3aA2ASI5 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Scn3aA2ASI5 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Scn3aA2ASI5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Scn3aA2ASI5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Scn3aA2ASI5 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Scn3aA2ASI5 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scn3aA2ASI5 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scn3aA2ASI5 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scn3aA2ASI5 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scn3aA2ASI5 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scn3aA2ASI5 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scn3aA2ASI5 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scn3aA2ASI5 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Scn3aA2ASI5 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Scn3aA2ASI5 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scn3aA2ASI5 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scn3aA2ASI5 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scn3aA2ASI5 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scn3aA2ASI5 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scn3aA2ASI5 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scn3aA2ASI5 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms