Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR2

4930447F04Rik, RIKEN cDNA 4930447F04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930447F04RikA2AFR2 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
4930447F04RikA2AFR2 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms