Protein–RNA interactions for Protein: A2AB62

1700023F06Rik, RIKEN cDNA 1700023F06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700023F06RikA2AB62 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
1700023F06RikA2AB62 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700023F06RikA2AB62 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700023F06RikA2AB62 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700023F06RikA2AB62 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700023F06RikA2AB62 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700023F06RikA2AB62 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700023F06RikA2AB62 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700023F06RikA2AB62 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
1700023F06RikA2AB62 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700023F06RikA2AB62 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
1700023F06RikA2AB62 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700023F06RikA2AB62 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700023F06RikA2AB62 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
1700023F06RikA2AB62 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700023F06RikA2AB62 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700023F06RikA2AB62 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
1700023F06RikA2AB62 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
1700023F06RikA2AB62 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700023F06RikA2AB62 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700023F06RikA2AB62 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700023F06RikA2AB62 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
1700023F06RikA2AB62 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
1700023F06RikA2AB62 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700023F06RikA2AB62 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700023F06RikA2AB62 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
1700023F06RikA2AB62 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
1700023F06RikA2AB62 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
1700023F06RikA2AB62 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.04■□□□□ -0
1700023F06RikA2AB62 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.04■□□□□ -0
1700023F06RikA2AB62 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
1700023F06RikA2AB62 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
1700023F06RikA2AB62 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
1700023F06RikA2AB62 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700023F06RikA2AB62 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
1700023F06RikA2AB62 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
1700023F06RikA2AB62 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700023F06RikA2AB62 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700023F06RikA2AB62 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700023F06RikA2AB62 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700023F06RikA2AB62 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700023F06RikA2AB62 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
1700023F06RikA2AB62 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700023F06RikA2AB62 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700023F06RikA2AB62 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
1700023F06RikA2AB62 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700023F06RikA2AB62 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700023F06RikA2AB62 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700023F06RikA2AB62 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700023F06RikA2AB62 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700023F06RikA2AB62 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700023F06RikA2AB62 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700023F06RikA2AB62 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.03■□□□□ -0
1700023F06RikA2AB62 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700023F06RikA2AB62 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.03■□□□□ -0
1700023F06RikA2AB62 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
1700023F06RikA2AB62 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700023F06RikA2AB62 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
1700023F06RikA2AB62 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700023F06RikA2AB62 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
1700023F06RikA2AB62 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700023F06RikA2AB62 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
1700023F06RikA2AB62 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700023F06RikA2AB62 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700023F06RikA2AB62 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
1700023F06RikA2AB62 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
1700023F06RikA2AB62 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
1700023F06RikA2AB62 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
1700023F06RikA2AB62 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
1700023F06RikA2AB62 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
1700023F06RikA2AB62 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
1700023F06RikA2AB62 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
1700023F06RikA2AB62 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
1700023F06RikA2AB62 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.02■□□□□ -0
1700023F06RikA2AB62 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
1700023F06RikA2AB62 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
1700023F06RikA2AB62 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
1700023F06RikA2AB62 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.02■□□□□ -0
1700023F06RikA2AB62 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.02■□□□□ -0
1700023F06RikA2AB62 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
1700023F06RikA2AB62 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
1700023F06RikA2AB62 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
1700023F06RikA2AB62 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
1700023F06RikA2AB62 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
1700023F06RikA2AB62 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
1700023F06RikA2AB62 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
1700023F06RikA2AB62 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
1700023F06RikA2AB62 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
1700023F06RikA2AB62 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
1700023F06RikA2AB62 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
1700023F06RikA2AB62 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
1700023F06RikA2AB62 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
1700023F06RikA2AB62 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
1700023F06RikA2AB62 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
1700023F06RikA2AB62 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
1700023F06RikA2AB62 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
1700023F06RikA2AB62 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
1700023F06RikA2AB62 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
1700023F06RikA2AB62 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
1700023F06RikA2AB62 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms