Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Prdm16A2A935 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
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Prdm16A2A935 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prdm16A2A935 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
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