Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms