Protein–RNA interactions for Protein: A0A0R4J054

4921501E09Rik, RIKEN cDNA 4921501E09, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921501E09RikA0A0R4J054 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4921501E09RikA0A0R4J054 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms