Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P1

Trbv30, T cell receptor beta, variable 30 (Fragment), mousemouse

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv30A0A0B4J1P1 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
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Trbv30A0A0B4J1P1 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Trbv30A0A0B4J1P1 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Trbv30A0A0B4J1P1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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