Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Knop1Q9Z2Q2 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms