Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mbd3Q9Z2D8 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms