Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z261

Cldn7, Claudin-7, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn7Q9Z261 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn7Q9Z261 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms