Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn8Q9Z260 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn8Q9Z260 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn8Q9Z260 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn8Q9Z260 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn8Q9Z260 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn8Q9Z260 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn8Q9Z260 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn8Q9Z260 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn8Q9Z260 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn8Q9Z260 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn8Q9Z260 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn8Q9Z260 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn8Q9Z260 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cldn8Q9Z260 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn8Q9Z260 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn8Q9Z260 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn8Q9Z260 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn8Q9Z260 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn8Q9Z260 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn8Q9Z260 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn8Q9Z260 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn8Q9Z260 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn8Q9Z260 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn8Q9Z260 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn8Q9Z260 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn8Q9Z260 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn8Q9Z260 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn8Q9Z260 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Cldn8Q9Z260 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn8Q9Z260 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn8Q9Z260 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn8Q9Z260 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn8Q9Z260 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn8Q9Z260 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn8Q9Z260 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn8Q9Z260 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn8Q9Z260 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn8Q9Z260 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn8Q9Z260 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn8Q9Z260 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn8Q9Z260 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn8Q9Z260 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn8Q9Z260 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn8Q9Z260 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn8Q9Z260 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn8Q9Z260 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn8Q9Z260 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn8Q9Z260 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn8Q9Z260 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn8Q9Z260 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn8Q9Z260 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn8Q9Z260 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn8Q9Z260 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn8Q9Z260 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn8Q9Z260 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn8Q9Z260 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn8Q9Z260 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn8Q9Z260 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn8Q9Z260 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn8Q9Z260 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn8Q9Z260 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn8Q9Z260 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn8Q9Z260 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn8Q9Z260 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn8Q9Z260 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn8Q9Z260 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn8Q9Z260 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn8Q9Z260 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn8Q9Z260 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn8Q9Z260 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn8Q9Z260 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn8Q9Z260 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn8Q9Z260 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn8Q9Z260 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn8Q9Z260 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn8Q9Z260 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn8Q9Z260 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn8Q9Z260 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn8Q9Z260 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn8Q9Z260 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn8Q9Z260 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn8Q9Z260 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn8Q9Z260 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn8Q9Z260 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn8Q9Z260 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn8Q9Z260 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn8Q9Z260 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn8Q9Z260 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn8Q9Z260 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn8Q9Z260 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn8Q9Z260 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn8Q9Z260 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn8Q9Z260 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn8Q9Z260 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn8Q9Z260 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn8Q9Z260 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn8Q9Z260 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn8Q9Z260 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn8Q9Z260 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms