Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ap3b1Q9Z1T1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms