Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
VarsQ9Z1Q9 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VarsQ9Z1Q9 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.4 ms