Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Lgr5Q9Z1P4 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Lgr5Q9Z1P4 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms