Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx39bQ9Z1N5 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms