Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W3

Nup160, Nuclear pore complex protein Nup160, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup160Q9Z0W3 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nup160Q9Z0W3 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nup160Q9Z0W3 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Nup160Q9Z0W3 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Nup160Q9Z0W3 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nup160Q9Z0W3 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nup160Q9Z0W3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Nup160Q9Z0W3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nup160Q9Z0W3 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nup160Q9Z0W3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nup160Q9Z0W3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nup160Q9Z0W3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nup160Q9Z0W3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nup160Q9Z0W3 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Nup160Q9Z0W3 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Nup160Q9Z0W3 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nup160Q9Z0W3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nup160Q9Z0W3 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nup160Q9Z0W3 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nup160Q9Z0W3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nup160Q9Z0W3 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nup160Q9Z0W3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nup160Q9Z0W3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nup160Q9Z0W3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Nup160Q9Z0W3 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Nup160Q9Z0W3 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nup160Q9Z0W3 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Nup160Q9Z0W3 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nup160Q9Z0W3 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nup160Q9Z0W3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nup160Q9Z0W3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nup160Q9Z0W3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nup160Q9Z0W3 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nup160Q9Z0W3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nup160Q9Z0W3 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nup160Q9Z0W3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nup160Q9Z0W3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nup160Q9Z0W3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nup160Q9Z0W3 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Nup160Q9Z0W3 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nup160Q9Z0W3 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nup160Q9Z0W3 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nup160Q9Z0W3 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nup160Q9Z0W3 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nup160Q9Z0W3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nup160Q9Z0W3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nup160Q9Z0W3 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nup160Q9Z0W3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nup160Q9Z0W3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nup160Q9Z0W3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Nup160Q9Z0W3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nup160Q9Z0W3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nup160Q9Z0W3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nup160Q9Z0W3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nup160Q9Z0W3 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Nup160Q9Z0W3 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Nup160Q9Z0W3 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Nup160Q9Z0W3 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nup160Q9Z0W3 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nup160Q9Z0W3 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Nup160Q9Z0W3 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nup160Q9Z0W3 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nup160Q9Z0W3 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nup160Q9Z0W3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nup160Q9Z0W3 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nup160Q9Z0W3 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Nup160Q9Z0W3 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Nup160Q9Z0W3 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nup160Q9Z0W3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nup160Q9Z0W3 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nup160Q9Z0W3 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nup160Q9Z0W3 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nup160Q9Z0W3 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nup160Q9Z0W3 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nup160Q9Z0W3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nup160Q9Z0W3 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nup160Q9Z0W3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nup160Q9Z0W3 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Nup160Q9Z0W3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nup160Q9Z0W3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nup160Q9Z0W3 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nup160Q9Z0W3 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Nup160Q9Z0W3 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nup160Q9Z0W3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nup160Q9Z0W3 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nup160Q9Z0W3 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Nup160Q9Z0W3 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nup160Q9Z0W3 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nup160Q9Z0W3 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nup160Q9Z0W3 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Nup160Q9Z0W3 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nup160Q9Z0W3 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nup160Q9Z0W3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nup160Q9Z0W3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nup160Q9Z0W3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nup160Q9Z0W3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nup160Q9Z0W3 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nup160Q9Z0W3 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nup160Q9Z0W3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nup160Q9Z0W3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms