Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E2

Chrd, Chordin, mousemouse

Predictions only

Length 948 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChrdQ9Z0E2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChrdQ9Z0E2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChrdQ9Z0E2 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChrdQ9Z0E2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChrdQ9Z0E2 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChrdQ9Z0E2 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChrdQ9Z0E2 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChrdQ9Z0E2 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChrdQ9Z0E2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChrdQ9Z0E2 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChrdQ9Z0E2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChrdQ9Z0E2 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChrdQ9Z0E2 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ChrdQ9Z0E2 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChrdQ9Z0E2 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChrdQ9Z0E2 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChrdQ9Z0E2 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChrdQ9Z0E2 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ChrdQ9Z0E2 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ChrdQ9Z0E2 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChrdQ9Z0E2 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ChrdQ9Z0E2 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChrdQ9Z0E2 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ChrdQ9Z0E2 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChrdQ9Z0E2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChrdQ9Z0E2 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChrdQ9Z0E2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChrdQ9Z0E2 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChrdQ9Z0E2 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChrdQ9Z0E2 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChrdQ9Z0E2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChrdQ9Z0E2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChrdQ9Z0E2 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChrdQ9Z0E2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChrdQ9Z0E2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChrdQ9Z0E2 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChrdQ9Z0E2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChrdQ9Z0E2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChrdQ9Z0E2 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChrdQ9Z0E2 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ChrdQ9Z0E2 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChrdQ9Z0E2 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChrdQ9Z0E2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChrdQ9Z0E2 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChrdQ9Z0E2 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChrdQ9Z0E2 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChrdQ9Z0E2 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChrdQ9Z0E2 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChrdQ9Z0E2 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChrdQ9Z0E2 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChrdQ9Z0E2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChrdQ9Z0E2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChrdQ9Z0E2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChrdQ9Z0E2 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChrdQ9Z0E2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChrdQ9Z0E2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChrdQ9Z0E2 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChrdQ9Z0E2 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChrdQ9Z0E2 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChrdQ9Z0E2 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChrdQ9Z0E2 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChrdQ9Z0E2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChrdQ9Z0E2 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChrdQ9Z0E2 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChrdQ9Z0E2 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChrdQ9Z0E2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChrdQ9Z0E2 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChrdQ9Z0E2 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChrdQ9Z0E2 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChrdQ9Z0E2 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChrdQ9Z0E2 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChrdQ9Z0E2 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ChrdQ9Z0E2 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChrdQ9Z0E2 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChrdQ9Z0E2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChrdQ9Z0E2 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChrdQ9Z0E2 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChrdQ9Z0E2 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChrdQ9Z0E2 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChrdQ9Z0E2 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChrdQ9Z0E2 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChrdQ9Z0E2 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChrdQ9Z0E2 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChrdQ9Z0E2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChrdQ9Z0E2 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChrdQ9Z0E2 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChrdQ9Z0E2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChrdQ9Z0E2 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChrdQ9Z0E2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChrdQ9Z0E2 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChrdQ9Z0E2 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ChrdQ9Z0E2 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChrdQ9Z0E2 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChrdQ9Z0E2 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ChrdQ9Z0E2 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChrdQ9Z0E2 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChrdQ9Z0E2 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChrdQ9Z0E2 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChrdQ9Z0E2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChrdQ9Z0E2 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms