Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU28

Pfdn5, Prefoldin subunit 5, mousemouse

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn5Q9WU28 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
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