Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Col4a3Q9QZS0 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col4a3Q9QZS0 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms