Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

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Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Six6Q9QZ28 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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