Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpsf3Q9QXK7 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpsf3Q9QXK7 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpsf3Q9QXK7 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpsf3Q9QXK7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpsf3Q9QXK7 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpsf3Q9QXK7 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpsf3Q9QXK7 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpsf3Q9QXK7 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpsf3Q9QXK7 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpsf3Q9QXK7 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpsf3Q9QXK7 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpsf3Q9QXK7 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpsf3Q9QXK7 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpsf3Q9QXK7 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpsf3Q9QXK7 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpsf3Q9QXK7 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpsf3Q9QXK7 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpsf3Q9QXK7 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpsf3Q9QXK7 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpsf3Q9QXK7 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpsf3Q9QXK7 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpsf3Q9QXK7 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpsf3Q9QXK7 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpsf3Q9QXK7 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpsf3Q9QXK7 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpsf3Q9QXK7 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpsf3Q9QXK7 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpsf3Q9QXK7 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpsf3Q9QXK7 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpsf3Q9QXK7 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpsf3Q9QXK7 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpsf3Q9QXK7 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpsf3Q9QXK7 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpsf3Q9QXK7 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpsf3Q9QXK7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpsf3Q9QXK7 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpsf3Q9QXK7 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpsf3Q9QXK7 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpsf3Q9QXK7 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpsf3Q9QXK7 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpsf3Q9QXK7 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpsf3Q9QXK7 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpsf3Q9QXK7 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpsf3Q9QXK7 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpsf3Q9QXK7 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpsf3Q9QXK7 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpsf3Q9QXK7 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpsf3Q9QXK7 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpsf3Q9QXK7 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpsf3Q9QXK7 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpsf3Q9QXK7 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpsf3Q9QXK7 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpsf3Q9QXK7 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpsf3Q9QXK7 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpsf3Q9QXK7 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpsf3Q9QXK7 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpsf3Q9QXK7 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpsf3Q9QXK7 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpsf3Q9QXK7 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpsf3Q9QXK7 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpsf3Q9QXK7 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpsf3Q9QXK7 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpsf3Q9QXK7 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Cpsf3Q9QXK7 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms