Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWH1

Phc2, Polyhomeotic-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 850 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phc2Q9QWH1 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Phc2Q9QWH1 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phc2Q9QWH1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phc2Q9QWH1 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Phc2Q9QWH1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phc2Q9QWH1 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phc2Q9QWH1 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phc2Q9QWH1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phc2Q9QWH1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phc2Q9QWH1 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phc2Q9QWH1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phc2Q9QWH1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phc2Q9QWH1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phc2Q9QWH1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phc2Q9QWH1 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phc2Q9QWH1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phc2Q9QWH1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phc2Q9QWH1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phc2Q9QWH1 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phc2Q9QWH1 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phc2Q9QWH1 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phc2Q9QWH1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phc2Q9QWH1 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phc2Q9QWH1 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phc2Q9QWH1 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phc2Q9QWH1 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phc2Q9QWH1 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phc2Q9QWH1 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phc2Q9QWH1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phc2Q9QWH1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phc2Q9QWH1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phc2Q9QWH1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phc2Q9QWH1 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phc2Q9QWH1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phc2Q9QWH1 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phc2Q9QWH1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phc2Q9QWH1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Phc2Q9QWH1 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phc2Q9QWH1 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phc2Q9QWH1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phc2Q9QWH1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phc2Q9QWH1 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phc2Q9QWH1 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phc2Q9QWH1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phc2Q9QWH1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phc2Q9QWH1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phc2Q9QWH1 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phc2Q9QWH1 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Phc2Q9QWH1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phc2Q9QWH1 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Phc2Q9QWH1 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phc2Q9QWH1 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phc2Q9QWH1 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phc2Q9QWH1 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phc2Q9QWH1 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phc2Q9QWH1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phc2Q9QWH1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phc2Q9QWH1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phc2Q9QWH1 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phc2Q9QWH1 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phc2Q9QWH1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phc2Q9QWH1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Phc2Q9QWH1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phc2Q9QWH1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phc2Q9QWH1 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phc2Q9QWH1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phc2Q9QWH1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phc2Q9QWH1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phc2Q9QWH1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phc2Q9QWH1 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phc2Q9QWH1 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phc2Q9QWH1 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phc2Q9QWH1 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phc2Q9QWH1 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Phc2Q9QWH1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phc2Q9QWH1 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phc2Q9QWH1 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phc2Q9QWH1 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Phc2Q9QWH1 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Phc2Q9QWH1 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Phc2Q9QWH1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Phc2Q9QWH1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Phc2Q9QWH1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Phc2Q9QWH1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Phc2Q9QWH1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Phc2Q9QWH1 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Phc2Q9QWH1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Phc2Q9QWH1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phc2Q9QWH1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phc2Q9QWH1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phc2Q9QWH1 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phc2Q9QWH1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phc2Q9QWH1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phc2Q9QWH1 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phc2Q9QWH1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phc2Q9QWH1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phc2Q9QWH1 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phc2Q9QWH1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phc2Q9QWH1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Phc2Q9QWH1 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms