Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms