Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rai2Q9QVY8 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms