Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cln8Q9QUK3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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