Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Higd1aQ9JLR9 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms