Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms