Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Scamp5Q9JKD3 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms