Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gfra4Q9JJT2 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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