Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
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Usp29Q9ES63 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
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Usp29Q9ES63 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
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Usp29Q9ES63 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp29Q9ES63 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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