Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER88

Dap3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dap3Q9ER88 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Dap3Q9ER88 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dap3Q9ER88 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dap3Q9ER88 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dap3Q9ER88 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dap3Q9ER88 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dap3Q9ER88 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dap3Q9ER88 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dap3Q9ER88 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dap3Q9ER88 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dap3Q9ER88 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dap3Q9ER88 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dap3Q9ER88 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dap3Q9ER88 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dap3Q9ER88 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Dap3Q9ER88 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dap3Q9ER88 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dap3Q9ER88 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dap3Q9ER88 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dap3Q9ER88 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dap3Q9ER88 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dap3Q9ER88 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dap3Q9ER88 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dap3Q9ER88 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dap3Q9ER88 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dap3Q9ER88 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dap3Q9ER88 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dap3Q9ER88 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Dap3Q9ER88 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dap3Q9ER88 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dap3Q9ER88 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dap3Q9ER88 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dap3Q9ER88 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dap3Q9ER88 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dap3Q9ER88 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dap3Q9ER88 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dap3Q9ER88 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dap3Q9ER88 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dap3Q9ER88 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dap3Q9ER88 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dap3Q9ER88 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dap3Q9ER88 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Dap3Q9ER88 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dap3Q9ER88 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dap3Q9ER88 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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