Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER60

Scn4a, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,841 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4aQ9ER60 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scn4aQ9ER60 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scn4aQ9ER60 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scn4aQ9ER60 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scn4aQ9ER60 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scn4aQ9ER60 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scn4aQ9ER60 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scn4aQ9ER60 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Scn4aQ9ER60 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scn4aQ9ER60 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scn4aQ9ER60 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scn4aQ9ER60 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scn4aQ9ER60 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scn4aQ9ER60 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scn4aQ9ER60 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scn4aQ9ER60 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scn4aQ9ER60 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scn4aQ9ER60 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scn4aQ9ER60 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scn4aQ9ER60 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scn4aQ9ER60 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scn4aQ9ER60 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scn4aQ9ER60 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scn4aQ9ER60 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scn4aQ9ER60 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scn4aQ9ER60 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scn4aQ9ER60 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scn4aQ9ER60 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scn4aQ9ER60 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scn4aQ9ER60 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scn4aQ9ER60 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scn4aQ9ER60 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scn4aQ9ER60 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scn4aQ9ER60 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scn4aQ9ER60 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scn4aQ9ER60 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Scn4aQ9ER60 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Scn4aQ9ER60 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Scn4aQ9ER60 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scn4aQ9ER60 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scn4aQ9ER60 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scn4aQ9ER60 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scn4aQ9ER60 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scn4aQ9ER60 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scn4aQ9ER60 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scn4aQ9ER60 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scn4aQ9ER60 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scn4aQ9ER60 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scn4aQ9ER60 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scn4aQ9ER60 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scn4aQ9ER60 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scn4aQ9ER60 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Scn4aQ9ER60 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Scn4aQ9ER60 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Scn4aQ9ER60 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Scn4aQ9ER60 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scn4aQ9ER60 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scn4aQ9ER60 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scn4aQ9ER60 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scn4aQ9ER60 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Scn4aQ9ER60 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scn4aQ9ER60 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scn4aQ9ER60 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Scn4aQ9ER60 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Scn4aQ9ER60 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scn4aQ9ER60 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scn4aQ9ER60 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scn4aQ9ER60 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scn4aQ9ER60 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scn4aQ9ER60 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scn4aQ9ER60 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scn4aQ9ER60 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scn4aQ9ER60 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scn4aQ9ER60 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scn4aQ9ER60 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scn4aQ9ER60 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scn4aQ9ER60 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scn4aQ9ER60 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scn4aQ9ER60 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scn4aQ9ER60 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scn4aQ9ER60 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scn4aQ9ER60 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scn4aQ9ER60 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scn4aQ9ER60 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Scn4aQ9ER60 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scn4aQ9ER60 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scn4aQ9ER60 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scn4aQ9ER60 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scn4aQ9ER60 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scn4aQ9ER60 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Scn4aQ9ER60 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Scn4aQ9ER60 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Scn4aQ9ER60 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Scn4aQ9ER60 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Scn4aQ9ER60 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Scn4aQ9ER60 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scn4aQ9ER60 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scn4aQ9ER60 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scn4aQ9ER60 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scn4aQ9ER60 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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