Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH7

Ndst3, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst3Q9EQH7 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ndst3Q9EQH7 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms