Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ47

Vmn1r44, Vomeronasal type-1 receptor 44, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r44Q9EQ47 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r44Q9EQ47 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms