Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SgshQ9EQ08 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms