Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPZ6

Tbx18, T-box transcription factor TBX18, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbx18Q9EPZ6 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tbx18Q9EPZ6 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tbx18Q9EPZ6 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tbx18Q9EPZ6 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tbx18Q9EPZ6 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tbx18Q9EPZ6 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tbx18Q9EPZ6 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tbx18Q9EPZ6 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tbx18Q9EPZ6 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tbx18Q9EPZ6 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Tbx18Q9EPZ6 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tbx18Q9EPZ6 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tbx18Q9EPZ6 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Tbx18Q9EPZ6 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tbx18Q9EPZ6 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tbx18Q9EPZ6 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tbx18Q9EPZ6 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tbx18Q9EPZ6 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tbx18Q9EPZ6 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tbx18Q9EPZ6 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tbx18Q9EPZ6 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tbx18Q9EPZ6 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tbx18Q9EPZ6 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tbx18Q9EPZ6 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tbx18Q9EPZ6 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tbx18Q9EPZ6 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tbx18Q9EPZ6 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tbx18Q9EPZ6 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tbx18Q9EPZ6 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tbx18Q9EPZ6 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tbx18Q9EPZ6 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tbx18Q9EPZ6 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tbx18Q9EPZ6 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tbx18Q9EPZ6 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tbx18Q9EPZ6 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tbx18Q9EPZ6 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tbx18Q9EPZ6 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tbx18Q9EPZ6 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Tbx18Q9EPZ6 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tbx18Q9EPZ6 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tbx18Q9EPZ6 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tbx18Q9EPZ6 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tbx18Q9EPZ6 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tbx18Q9EPZ6 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tbx18Q9EPZ6 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tbx18Q9EPZ6 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tbx18Q9EPZ6 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tbx18Q9EPZ6 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tbx18Q9EPZ6 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tbx18Q9EPZ6 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tbx18Q9EPZ6 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tbx18Q9EPZ6 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tbx18Q9EPZ6 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tbx18Q9EPZ6 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tbx18Q9EPZ6 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tbx18Q9EPZ6 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tbx18Q9EPZ6 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Tbx18Q9EPZ6 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Tbx18Q9EPZ6 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tbx18Q9EPZ6 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tbx18Q9EPZ6 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tbx18Q9EPZ6 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tbx18Q9EPZ6 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tbx18Q9EPZ6 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tbx18Q9EPZ6 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tbx18Q9EPZ6 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tbx18Q9EPZ6 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tbx18Q9EPZ6 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tbx18Q9EPZ6 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tbx18Q9EPZ6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tbx18Q9EPZ6 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tbx18Q9EPZ6 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tbx18Q9EPZ6 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tbx18Q9EPZ6 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tbx18Q9EPZ6 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tbx18Q9EPZ6 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tbx18Q9EPZ6 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tbx18Q9EPZ6 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tbx18Q9EPZ6 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tbx18Q9EPZ6 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tbx18Q9EPZ6 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tbx18Q9EPZ6 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tbx18Q9EPZ6 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tbx18Q9EPZ6 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tbx18Q9EPZ6 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tbx18Q9EPZ6 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tbx18Q9EPZ6 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tbx18Q9EPZ6 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tbx18Q9EPZ6 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tbx18Q9EPZ6 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tbx18Q9EPZ6 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tbx18Q9EPZ6 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tbx18Q9EPZ6 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tbx18Q9EPZ6 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tbx18Q9EPZ6 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tbx18Q9EPZ6 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tbx18Q9EPZ6 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tbx18Q9EPZ6 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tbx18Q9EPZ6 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tbx18Q9EPZ6 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms